为学校法人东京医科大学运营的大学医院。成立于1916年，已创立百年。目前共拥有1015张病床，拥有医生及护士等2599名。东京医科大学病院中央检查部，于2015年3月12日取得了国际规格ISO15189：2012「临床检查室－品质和能力特定要求事项」的认定。（认定号码RML00900）。东京医科大学附属医院在泌尿科、脑神经外科等都具备非常出色的研究能力及丰富的临床经验。泌尿科不仅包括常规的改善疾病，更能在改善后注意养护器官功能。同时创新使用对身体负担较小的机器人支援手术作为这其中的一环。同时，针对前列腺癌的机器人支援手术于2006年8月首次在日本进行。此外，针对其他器官（肾脏、肾上腺）的手术，也在积极引进使用腹腔镜的低侵袭手术。
主要科室
内科：呼吸器内科、循环器内科、内分泌代谢内科、血液内科、内视镜内科、肾脏内科、脑神经内科
外科：消化器外科、呼吸器外科、血管外科、心脏血管外科、脑神经外科、整形外科、乳腺外科
其他科室：耳鼻喉科、眼科、皮肤科、泌尿器科、放射线改善科、放射线诊断科、病例诊断科